最近要用R
语言进行生信分析,但是 mac 运算能力着实着急。刚好住的地方有一台服务器,自然想着能不能在服务器上跑。本来 mac 用ssh
来连接 Linux 服务器确实很方便,相关代码通过 terminal 运行。但是有以下的问题:
- 用户不太会用 Linux,只会用图形界面版的 R-Studio
- 即使用 ssh,住的地方的服务器缺少公网 ip,想用也没有办法
1. RStudio Server 介绍
R-Studio 是 R 的可视化编程界面(IDE),可写 R 代码并运行。现在有本地客户端和服务器两种版本:
- 本地版本全部在本地运行,不需要服务器,依靠本地机器的性能
- 服务器版本可以充分利用服务器的强大算力,其它电脑可以通过浏览器访问,体验和本地使用 R-Studio 一样
2. 安装过程
直接按照官网教程来就行:
1 选择操作系统
选择RedHat/CentOS中的RedHat9。
2 安装R
sudo dnf install R
sudo dnf install R-devel
安装好之后,可以在命令行中运行R:
R
wget https://download2.rstudio.org/server/rhel9/x86_64/rstudio-server-rhel-2023.06.0-421-x86_64.rpm
sudo yum install rstudio-server-rhel-2023.06.0-421-x86_64.rpm
3. 配置与启动
使用systemd来管理rstudio-server服务。
正在运行的状态
sudo systemctl status rstudio-server.service
● rstudio-server.service - RStudio Server
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/rstudio-server.service; enabled; vendor preset: disabled)
Active: active (running) since Thu 2020-10-22 20:37:02 CST; 1h 54min ago
Process: 966 ExecStart=/usr/libexec/rstudio/bin/rserver (code=exited, status=0/SUCCESS)
Main PID: 986 (rserver)
Tasks: 3 (limit: 19067)
Memory: 63.8M
CPU: 2.198s
CGroup: /system.slice/rstudio-server.service
└─986 /usr/libexec/rstudio/bin/rserver
Oct 22 20:37:02 server systemd[1]: Starting RStudio Server...
Oct 22 20:37:02 server systemd[1]: Started RStudio Server.
未在运行的状态
sudo systemctl status rstudio-server.service
● rstudio-server.service - RStudio Server
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/rstudio-server.service; enabled; vendor preset: disabled)
Active: inactive (dead) since Thu 2020-10-22 22:34:05 CST; 1s ago
Process: 966 ExecStart=/usr/libexec/rstudio/bin/rserver (code=exited, status=0/SUCCESS)
Process: 6034 ExecStop=/usr/bin/killall -TERM rserver (code=exited, status=0/SUCCESS)
Main PID: 986 (code=killed, signal=TERM)
CPU: 2.246s
Oct 22 20:37:02 server systemd[1]: Starting RStudio Server...
Oct 22 20:37:02 server systemd[1]: Started RStudio Server.
Oct 22 22:34:05 server systemd[1]: Stopping RStudio Server...
Oct 22 22:34:05 server systemd[1]: rstudio-server.service: Succeeded.
Oct 22 22:34:05 server systemd[1]: Stopped RStudio Server.
Oct 22 22:34:05 server systemd[1]: rstudio-server.service: Consumed 2.246s CPU time.
一些systemd的命令
sudo systemctl start rstudio-server.service # 启动
sudo systemctl stop rstudio-server.service # 停止
sudo systemctl enable rstudio-server.service # 设定开机启动
sudo systemctl disable rstudio-server.service # 取消开机启动
4. 浏览器访问RStudio-Server
在另外一个处于同一个网络的机器上,打开浏览器,输入http://server_ip:8787 就能访问了。
输入账户密码后,就可以进行操作了:
对于移动宽带来说,虽然没有公网ipv4地址,但是可能有公网ipv6地址。访问http://[server_ipv6]:8787就可以了。 需要注意,一般是要把台式机直接接到移动光猫上,而不是通过路由器连接。
除了直接用移动公网ip来访问,可以用ssh 或者 cloudflare的zerotrust 进行内网穿透。可以查看这里。
总结
本文介绍了RStudio Server的安装和远程访问。